A comprehensive evaluation of long read error correction methods
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
the effects of error correction methods on pronunciation accuracy
هدف از انجام این تحقیق مشخص کردن موثرترین متد اصلاح خطا بر روی دقت آهنگ و تاکید تلفظ کلمه در زبان انگلیسی بود. این تحقیق با پیاده کردن چهار متد ارائه اصلاح خطا در چهار گروه، سه گروه آزمایشی و یک گروه تحت کنترل، انجام شد که گروه های فوق الذکر شامل دانشجویان سطح بالای متوسط کتاب اول passages بودند. گروه اول شامل 15، دوم 14، سوم 15 و آخرین 16 دانشجو بودند. دوره مربوطه به مدت 10 هفته ادامه یافت و د...
15 صفحه اولLoRDEC: accurate and efficient long read error correction
MOTIVATION PacBio single molecule real-time sequencing is a third-generation sequencing technique producing long reads, with comparatively lower throughput and higher error rate. Errors include numerous indels and complicate downstream analysis like mapping or de novo assembly. A hybrid strategy that takes advantage of the high accuracy of second-generation short reads has been proposed for cor...
متن کاملSHREC: a short-read error correction method
MOTIVATION Second-generation sequencing technologies produce a massive amount of short reads in a single experiment. However, sequencing errors can cause major problems when using this approach for de novo sequencing applications. Moreover, existing error correction methods have been designed and optimized for shotgun sequencing. Therefore, there is an urgent need for the design of fast and acc...
متن کاملthe effect of explicit versus implicit error correction on writing of iranian intermediate efl learners
در این پایان نامه دو روش اصلاح اشتباهات نوشتاری زبان آموزان بزرگسال ایرانی در سطح متوسط مورد بررسی قرار می گیرد. در روش اول (explicit) اشتباهات بطور مستقیم و در روش دوم (implicit) اشتباهات بصورت غیر مستقیم اصلاح می شود. برای انجام این تحقیق از دو گروه 15 نفری استفاده شده است. به زبان آموزان در هر جلسه یک موضوع انشا داده شده است. این کار در 15 هفته (15 جلسه) تکرار شده است. مقایسه نتایج این آزمون...
ECHO: a reference-free short-read error correction algorithm.
Developing accurate, scalable algorithms to improve data quality is an important computational challenge associated with recent advances in high-throughput sequencing technology. In this study, a novel error-correction algorithm, called ECHO, is introduced for correcting base-call errors in short-reads, without the need of a reference genome. Unlike most previous methods, ECHO does not require ...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: BMC Genomics
سال: 2020
ISSN: 1471-2164
DOI: 10.1186/s12864-020-07227-0